Alignment of NLV strains where age is >80


            0         10        20        30   
            |---------|---------|---------|----
HILLINGDON  GCTGACTCTCTGTGCTTTGTCTGAAGTCACCAACC
MELKSHAM    CCTCACCCTATGTGCTCTTTCTGAAGTCACAGACC
HARROW_II   CCTAACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
HAWAII_Rot  CCTCACACTCTGCGCACTCTCTGAAACTACAAATC
BRISTOL_Gr  TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
HAWAII_Ste  TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATT
TORONTO_24  GCTTACTCTGTGTGCCCTTTCTGAAGTGACAGGAC
AMSTERDAM_  CCTGACCCTCAGTGCTATGTCCGAGGTCTCTGGTC
LEEDS_Guer  CCTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
SOUTHAMPTO  GATAACTTTGTGTGCCCTCTCTGAGGTTACTGGCC
VALETTA     GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCT
DESERT_SHI  CCTAACTCTATGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGTT
KSR2A/2001  CTATACTTTGTGTGCCTTATCAGAAGTTACTGGCT
GHANA       AATCACCCTTTGTGCCCTCTCTGAAGTCACCGGAC
NORWALK_Ro  AATTACCCTCTGTGCACTCTCTGAAGCCACCGGTC
ALPHATON_S  CGTCACTCTCACATCCATGGCTGAGGCCACTGGCC
2133887     GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCT
2123751     GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCT
2105971     TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATT
2123740     GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCT
2006998     GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCT
2130469     GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCT
2131528     TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATT
2116105     TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATT
2123361     TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATT
2045584     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2203976     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2206617     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2156021     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2202601     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2203736     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2204260     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2207917     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2214335     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2216547     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2157754     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2164251     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2202381     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2210124     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2209262     CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2123776     CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2111001     CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2102973     CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2102983     CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2111011     CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2111575     CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2120015     CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2127944     CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2123333     CCTCACACTATGCGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2230887     CCTAACACTATGTGCGATGTCTGAAGTCACAGATC
2205504     CCTCACGCTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2208948     CCTCACGCTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2123730     CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2111010     TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAATTGACAAATT
2225876     ACTCACACTATGTGCACTGTCTGAAATCACAGATC
2114928     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2011896     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCGGAAGTTACAAACT
2014310     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2214948     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2218183     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2226540     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2228068     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2228070     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2202821     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACCAACT
2205768     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACCAACT
2127942     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACCAACT
2215856     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACCAACT
2216829     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACCAACT
9904812     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACC
2010972     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACC
2010977     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACC
2238701     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2280825     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2245911     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2247170     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2221922     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2228074     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2241812     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2260904     TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2239584     TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2137653     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATT
2215842     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATT
2239601     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATT
2226538     TCTCACACTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2279859     TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2280823     TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2011724     CCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2209263     CCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2211999     CCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2219966     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAGCT
2317184     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2252947     TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2218749     TCTCACTCTTTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2202841     CCTCACTCTTTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2203464     TCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAATT
2204081     TCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAATT
2128645     TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2212295     TCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACT
2211994     TCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACT
2210928     TCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACT
2212919     TCTCACCCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACT
2129391     CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACC
2131525     CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACC
2156840     CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACT
2244253     GATAACTTTGTGTGCCCTCTCTGAGGTGACTGGCC
2203962     CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACC
2205339     CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACC
2206603     CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACC
2210145     CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACC
2222757     CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTCACAAACC
2123338     CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACC
2124798     CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTCACAAGCC
2019147     TCTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2011183     GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCT
2015949     CCTAACTCTGTGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCT
2028021     CCTAACTCTGTGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCC
2123349     CCTAACCCTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2152713     CCTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2152712     CTTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2028022     CCTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2152734     CTTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2201141     ACTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2157302     CCTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2027985     CCTCACACTCTGCGCACTCTCTGAGATCACAAACC
2122049     CCTGACTCTGTGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCT
2326243     CCTAACCCTATGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCT
2011740     CCTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTCTCAGGTC
2152744     TCTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2112498     CCTCACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATC
2135928     CCTCACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATC
2046027     CCTTACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATC
2047495     CCTTACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATC
2028991     TCTCACATTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATC
2152746     CCTCACACTCTGTGCACTCTCTGAAGTAACAAATC
2045564     AATTACCCTCTGTGCCCTCTCTGAGGTTACTGGAC
2027966     CCTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2037307     CCTCACCCTTTGTGCACTCTCTGAAGTCACGAACC
9943442     CCTCACCCTTTGTGCACTCTCTGAAGTCACGAACC
2112710     CCTCACCCTTTGTGCACTCTCTGAAGTCACGAACC
2152781     TTACACTCTGTGTGCACTATCGGAAGTCACAGGCC