Alignment of NLV strains where age is >80
0 10 20 30
|---------|---------|---------|----
HILLINGDON GCTGACTCTCTGTGCTTTGTCTGAAGTCACCAACC
MELKSHAM CCTCACCCTATGTGCTCTTTCTGAAGTCACAGACC
HARROW_II CCTAACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
HAWAII_Rot CCTCACACTCTGCGCACTCTCTGAAACTACAAATC
BRISTOL_Gr TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
HAWAII_Ste TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATT
TORONTO_24 GCTTACTCTGTGTGCCCTTTCTGAAGTGACAGGAC
AMSTERDAM_ CCTGACCCTCAGTGCTATGTCCGAGGTCTCTGGTC
LEEDS_Guer CCTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
SOUTHAMPTO GATAACTTTGTGTGCCCTCTCTGAGGTTACTGGCC
VALETTA GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCT
DESERT_SHI CCTAACTCTATGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGTT
KSR2A/2001 CTATACTTTGTGTGCCTTATCAGAAGTTACTGGCT
GHANA AATCACCCTTTGTGCCCTCTCTGAAGTCACCGGAC
NORWALK_Ro AATTACCCTCTGTGCACTCTCTGAAGCCACCGGTC
ALPHATON_S CGTCACTCTCACATCCATGGCTGAGGCCACTGGCC
2133887 GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCT
2123751 GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCT
2105971 TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATT
2123740 GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCT
2006998 GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCT
2130469 GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCT
2131528 TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATT
2116105 TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATT
2123361 TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAAGTGACAAATT
2045584 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2203976 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2206617 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2156021 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2202601 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2203736 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2204260 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2207917 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2214335 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2216547 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2157754 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2164251 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2202381 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2210124 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2209262 CCTCACACTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2123776 CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2111001 CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2102973 CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2102983 CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2111011 CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2111575 CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2120015 CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2127944 CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2123333 CCTCACACTATGCGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2230887 CCTAACACTATGTGCGATGTCTGAAGTCACAGATC
2205504 CCTCACGCTATGTGCGCTGTCTGAAGTCACAGATC
2208948 CCTCACGCTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2123730 CCTCACACTATGTGCACTGTCTGAAGTCACAGATC
2111010 TCTCACGCTCTGTGCACTCTCTGAATTGACAAATT
2225876 ACTCACACTATGTGCACTGTCTGAAATCACAGATC
2114928 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2011896 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCGGAAGTTACAAACT
2014310 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2214948 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2218183 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2226540 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2228068 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2228070 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2202821 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACCAACT
2205768 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACCAACT
2127942 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACCAACT
2215856 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACCAACT
2216829 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACCAACT
9904812 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACC
2010972 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACC
2010977 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACC
2238701 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2280825 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2245911 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2247170 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2221922 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2228074 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2241812 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2260904 TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2239584 TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2137653 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATT
2215842 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATT
2239601 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATT
2226538 TCTCACACTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2279859 TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2280823 TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2011724 CCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2209263 CCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2211999 CCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2219966 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAGCT
2317184 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2252947 TCTCACTCTCTGCGCGCTCTCTGAAGTTACAAATC
2218749 TCTCACTCTTTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2202841 CCTCACTCTTTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2203464 TCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAATT
2204081 TCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAATT
2128645 TCTCACTCTCTGTGCGCTCTCTGAAGTTACAAACT
2212295 TCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACT
2211994 TCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACT
2210928 TCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACT
2212919 TCTCACCCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACT
2129391 CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACC
2131525 CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACC
2156840 CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACT
2244253 GATAACTTTGTGTGCCCTCTCTGAGGTGACTGGCC
2203962 CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACC
2205339 CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACC
2206603 CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACC
2210145 CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACC
2222757 CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTCACAAACC
2123338 CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTTACAAACC
2124798 CCTCACTCTCTGTGCACTCTCTGAAGTCACAAGCC
2019147 TCTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2011183 GATCACATTGTGTGCCATGTCTGAAGTCACAGGCT
2015949 CCTAACTCTGTGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCT
2028021 CCTAACTCTGTGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCC
2123349 CCTAACCCTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2152713 CCTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2152712 CTTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2028022 CCTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2152734 CTTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2201141 ACTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2157302 CCTAACCTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2027985 CCTCACACTCTGCGCACTCTCTGAGATCACAAACC
2122049 CCTGACTCTGTGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCT
2326243 CCTAACCCTATGTGCACTGTCAGAAGTCACTGGCT
2011740 CCTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTCTCAGGTC
2152744 TCTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2112498 CCTCACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATC
2135928 CCTCACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATC
2046027 CCTTACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATC
2047495 CCTTACCTTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATC
2028991 TCTCACATTATGTGCCCTTTCTGAAGTTACAGATC
2152746 CCTCACACTCTGTGCACTCTCTGAAGTAACAAATC
2045564 AATTACCCTCTGTGCCCTCTCTGAGGTTACTGGAC
2027966 CCTAACTTTGAGTGCAATGGCAGAAGTGTCAGGTC
2037307 CCTCACCCTTTGTGCACTCTCTGAAGTCACGAACC
9943442 CCTCACCCTTTGTGCACTCTCTGAAGTCACGAACC
2112710 CCTCACCCTTTGTGCACTCTCTGAAGTCACGAACC
2152781 TTACACTCTGTGTGCACTATCGGAAGTCACAGGCC